Geoarchaeota

Geoarchaeota
Systematik
Klassifikation: Lebewesen
Domäne: Archaeen (Archaea)
Supergruppe: „Proteoarchaeota“
Reich: TACK-Superphylum (Thermoproteati)
Stamm: Geoarchaeota
Wissenschaftlicher Name
Geoarchaeota
Kozubal et al. 2013

„Candidatus Geoarchaeota“[1][2] (früher provisorisch „Novel archaeal group I“, NAG1,[2] auch Can­di­da­te division YNPFFA[3][A. 1]) ist ein vorgeschlagenes Phylum (Kandidatenphylum bzw. -abteilung, englisch Can­di­da­te Division) von Archaeen des Reichs Thermoproteati (früher „TACK-Super­phylum“). Nach anderer Ansicht hat die Klade (Verwandtchaftsgruppe) dieser Organismen lediglich den taxonomischen Rang einer Klasse mit der Bezeichnung „Geoarchaeia“[4][A. 2] (an­zu­neh­men­der­wei­se im Phylum Thermo­proteota, früher „Crenarchaeota“), oder gar nur einer Ordnung mit der Bezeichnung „Gearchaeales“ (in der Klasse Thermoprotei).[5][6]

Übereinstimmung besteht jedoch darin, dass die Gruppe der Ge(o)archaeen Teil des „TACK-Super­phylums“ ist, das 2024 als Reich (Biologie) Thermoproteati in die offiziell Prokaryoten-Taxonomie aufgenommen wurde.[1]

Da es bisher (Stand 1. Juli 2025) noch nicht möglich war, einzelne Vertreter zu kultivieren, stammt das bisherige Wissen stammt daher aus der Metagenomik und Einzelzell-Sequenzierungen. Diese Analysen ergaben, dass sie sich die Vertreter dieser Gruppe von anderen bisher bekannten Archaeen signifikant unterscheiden. Gefunden wurden diese Genome zuerst in den heißen Quellen vom Yellowstone-National­park. Die Mitglieder der Gruppe sind thermophile Organismen, die (acidophil) in saurem Milieu leben und Eisen (Fe3+) reduzieren (Eisenreduzierer). Genetische Analysen ergaben, dass diese Organismen über Stoffwechselwege verfügen, die für den Katabolismus von Peptiden und komplexen Kohlenhydraten notwendig sind, sowie über einen bakteriellen Typ-I-Kohlenmonoxid-Dehydrogenase-Komplex.[7]

Systematik

Die Zuordnung der (vorgeschlagenen) Ordnung „Geoarchaeales“ zu einem Archaeen-Phylum wird noch diskutiert. Die hier angegebene Systematik folgt im Wesentlichen der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[1] mit Ergänzungen, u. a. nach der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI):[2]

Phylum „Ca. Geoarchaeota“ Kozubal et al. 2013[7][8] (LPSN keinem Reich zugeordnet) [früher Novel archaeal group I, NAG1,[2][9] Can&sh;di­date division YNPFFA[3]][2][A. 3]

  • Klasse Geoarchaeia[4]
    • Ordnung Gearchaeales (GTDB)[A. 4]
      • Familie Gearchaeaceae (GTDB)
        • Gattung „Geoarchaeum“ Hunt et al. 2016 (LPSN)
        • Gattung AAA261-N23 (GTDB)
          • Spezies AAA261-N23 sp000375685 [Crenarchaeote SCGC AAA261-N23 (NCBI)], mit
            • Stamm SCGC AAA261-N23 – Fundort: Einzelzellisolat
        • Gattung DSF001 (GTDB)
          • Spezies DSFO01 sp021324265 [Thermoproteota archaeon isolate Centralia_MAG_457 (NCBI), Geobacterales bacterium isolate SMAG_U9863 (NCBI)], mit
        • Gattung SCGC-AAA471-B05 (GTDB)
          • Spezies SCGC-AAA471-B05 sp000380705 [Crenarchaeota archaeon SCGC AAA471-B05 (NCBI), Candidate division YNPFFA archaeon SCGC AAA471-B05 (NCBI)], mit
      • Familie f_WAQG01 (GTDB)
        • Gattung JAVZOV01
          • Spezies JAVZOV01 sp038881895 [Thermoprotei archaeon isolate DRTY-6_202007_bins_28 (NCBI)], mit
            • Stamm DRTY-6_202007_bins_28 – Thermalquellbecken DRTY-6, Tengchong, Yunnan, China
        • Gattung WAQG01
  • ohne Klassen-, Ordnungs-, Familien- und Gattungszuweisung (NCBI)
  • Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-C13
  • Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-C20
  • Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-E11
  • Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-G12
  • Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-L10
  • Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-M09
  • ohne eigene Spezies

Etymologie

Die Bezeichnung des Kandidatenphylums „Geoarchaeota“ leitet sich ab von altgriechisch γῆ gē, deutsch ‚Erde‘[7] (vgl. Geologie, Geographie), versehen mit dem Suffix ‚-archaota‘ für Archaeenphyla. Entsprechendes gilt für den Namen der (erst darauf folgend) vorgeschlagenen Typusgattung, „Geoarchaeum“, der Suffix ‚-archaeum‘ verweist wie sonst auch üblich auf eine Archaeengattung. Analog ist die Klassenbezeichnung „Geoarchaeia“ mit dem Suffix ‚-archaeia‘ für Archaeenklassen versehen.

Der Ordnungsname „Gearchaeales“ und der Familienname „Gearchaeaceae“ tragen ebenso die Endungen ‚-archaeales‘ bzw. ‚-archaeaceae‘ für Archaeenordnungen respektive -familien; zusätzlich hat man in der GTDB das ‚o‘ als Füllsel in der Mitte dreier aufeinanderfolgender Vokale entsprechend antiker Gepflogenheiten (lateinisch) gestrichen – in derselben Weise wie bei anderen Taxonbezeichnungen, vgl. z. B. die frühere Kandidatengattung (und heutige Gattung) Promethe(o)archaeum.

Anmerkungen

  1. ↑ mit YNP für Yellowstone-Nationalpark
  2. ↑ Der Suffix ‚-archaeia‘ bedeutet, dass die Klade von den Autoren als Archaeenklasse angesehen wird.
  3. ↑ in der GTDB zur Klasse Thermoprotei.
  4. ↑ wg. S146_104_esom

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c LPSN: Phylum "Candidatus Geoarchaeota" Kozubal et al. 2013.
  2. ↑ a b c d e NCBI Taxonomy Browser: Candidatus Geoarchaeota, Details: Candidatus Geoarchaeota Kozubal et al. 2013, heterotypic synonym: novel archaeal group I, NAG1. Rank: phylum. Graphisch: Candidatus Geoarchaeota, auf: Lifemap.
  3. ↑ a b Candidate phylum "YNPFFA" (prokaryote). The Taxonomicon. Universal Taxonomic Services, Zwaag, Niederlande (taxonomy.nl). Stand: 1. Februar 2024.
  4. ↑ a b Anthony J. Kohtz, Zackary J. Jay, Mackenzie M. Lynes, Viola Krukenberg, Roland Hatzenpichler: Culexarchaeia, a novel archaeal class of anaerobic generalists inhabiting geothermal environments. In: ISME Communications, Band 2, Nr. 1, Dezember 2022, S. 86; doi:10.1038/s43705-022-00175-8, PMC9723716 (freier Volltext, Memento im Webarchiv vom 8. Februar 2025), PMID 37938354, ResearchGate:363704306, Epub: 20. September 2022 (englisch).
  5. ↑ GTDB: Gearchaeales (order).
  6. ↑ Lionel Guy, Anja Spang, Jimmy H. Saw, Thijs J. G. Ettema: 'Geoarchaeote NAG1' is a deeply rooting lineage of the archaeal order Thermoproteales rather than a new phylum, in: The ISME journal, Band 8, Nr. 7, S. 1353–1357, 13. Februar 2014, doi:10.1038/ismej.2014.6.
  7. ↑ a b c d Mark A. Kozubal, Margaret Romine, Ryan de Montmollin Jennings, Zack J. Jay, Susannah G. Tringe, Doug B. Rusch, Jacob P. Beam, Lee Ann McCue, William P. Inskeep: Geoarchaeota: a new candidate phylum in the Archaea from high-temperature acidic iron mats in Yellowstone National Park. In: The ISME Journal, Band 7, Nr. 3, März 2013, S. 622–634; doi:10.1038/ismej.2012.132, PMC 3578567 (freier Volltext), PMID 23151644, Epub 15. November 2012 (englisch).
  8. ↑ Cindy J. Castelle, Jillian F. Banfield: Major New Microbial Groups Expand Diversity and Alter our Understanding of the Tree of Life. In: Cell. 172. Jahrgang, Nr. 6, 8. März 2018, S. 1181–1197, doi:10.1016/j.cell.2018.02.016, PMID 29522741 (englisch).
  9. ↑ Panagiotis S. Adam, Guillaume Borrel, Céline Brochier-Armanet, Simonetta Gribaldo: The growing tree of Archaea: new perspectives on their diversity, evolution and ecology. In: The ISME journal. Band 11, Nr. 11, November 2017, ISSN 1751-7370, S. 2407–2425, doi:10.1038/ismej.2017.122, PMID 28777382, PMC 5649171 (freier Volltext) – (englisch).
  10. ↑ Kristopher A. Hunt, Ryan de Montmollin Jennings, William P. Inskeep, Ross P. Carlson: Stoichiometric modelling of assimilatory and dissimilatory biomass utilisation in a microbial community. In: Environmental Microbiology, Band 18, Nr. 12, Dezember 2016, S. 4946–4960; doi:10.1111/1462-2920.13444, Epub 7. Juli 2016 (englisch).
  11. ↑ a b Brothers Seamount. GeoNames.
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