Oscillospiraceae

Oscillospiraceae

Transmissionselektronenmikroskopische Aufnahmen der Stämme M00118T (a1, a2, a3), M00184T (b1, b2, b3) und M00204T (c1, c2, c3). Die Geißeln der Bakterienstämme sind mit Pfeilen gekennzeichnet. M00118T = A. caecimuris, M00204T = A. intestini, M00184T = N. caecimuris

Systematik
Klassifikation: Lebewesen
Domäne: Bakterien (Bacteria)
Abteilung: Bacillota
Klasse: Clostridia
Ordnung: Eubacteriales
Familie: Oscillospiraceae
Wissenschaftlicher Name
Oscillospiraceae
Peshkoff 1940 (Approved Lists 1980)

Die Oscillospiraceae sind eine Familie von Bakterien. Hier sind viele Gattungen vereint, welche besonders in Hinsicht der Darmflora verschiedener Wirbeltiere, einschließlich des Menschens, wichtig sind. Metagenomische Studien haben die Präsenz vieler dieser Gattungen im Darmtrakt verschiedener Organismen nachgewiesen und ihre potenzielle Rolle in Gesundheit und Krankheit werden untersucht. Einige Arten werden in Hinsicht auf die Nutzung als Probiotika untersucht. Es sind freilebende Arten vorhanden.

Merkmale

Die Zellform der einzelnen Arten ist unterschiedlich, es sind stäbchenförmige Arten vorhanden, wie z. B. Pseudoflavonifractor. Auch Kokken treten auf, wie z. B. Zellen von Ruminococcoides. Gemmiger ist ei- bis sanduhrförmig (0,9–2,5 × 1,0 µm), die Zellen teilen sich scheinbar an einer Verengung und erwecken so den Eindruck einer Knospung. Schnell wachsende Zellen von Gemmiger können Ketten bilden. Der Gram-Test verläuft je nach Art unterschiedlich.

Stoffwechsel und Wachstum

Die Gattungen sind anaerob, sie tolerieren keinen Sauerstoff. Sie führen die Gärung (Fermentation) zur Energiegewinnung durch und bilden hierdurch kurzkettige Fettsäuren, insbesondere Butyrat. Dies ist wichtig für die Aufrechterhaltung der Darmgesundheit.[1][2]

Es folgt eine Tabelle mit einigen Arten:

Morphologie Stoffwechsel Vorkommen
Acutalibacter[3] Gram-negativ, Stäbchen, bildet Endosporen, motile Zellen wurden nicht beobachtet, aber mit der Motilität verbundene Proteine sind im Genom kodiert Kein Wachstum auf festem Medium, komplexe flüssige Medien erforderlich im menschlichem Kot, Darm oder dem Magen-Darm-Trakt von Tieren
Anaerotruncus[4] nicht beweglich, Gram-positiv, Stäbchen, bilden gelegentlich ovale, terminale Sporen bildet durch Fermentation Acetat und Butyrat, toleriert ein breites pH-Spektrum (pH 5,5 bis 11) menschlicher Darm
Butyricicoccus[5][6] Gram-positiv, Kokken, nicht motil, nicht sporenbildend Hauptsächlich Butyratproduktion (Fermentation) Darmtrakt von Tier, z. B. bei Hühnern und Menschen
Ethanoligenens[7] Gram-positiv, nicht sporenbildend, Stäbchen, motil Fermentation zu Acetat, Ethanol, H2 und CO2 Anaerobe Umgebungen (Belebtschlamm)
Faecalibacterium[8][9] Gram-positiv, Stäbchenförmig, bei F. prausnitzii manchmal mit Schwellungen, nicht beweglich, nicht sporenbildend Fermentation u. a. zu Butyrat, baut Polysaccharide ab Darmtrakt (Tier und Mensch)
Gemmiger[10] Gram-variabel, Eiförmige bis sanduhrförmig, nicht sporenbildend, nicht motil Fermentation zu Formiat, Butyrat, Lactat Darmtrakt (Vogel und Mensch)
Intestinimonas[11] Gram-positiv, Stäbchen, sporenbildend Fermentation von Fructoselysin zu Butyrat Menschlicher Darm, auch in anderen Tieren, darunter Mäusen und Schweinen
Oscillospira[12] Gram-positiv oder negativ, bildet Sporen, motil, Die Zellen von O. guilliermondii sind sehr groß (etwa 5–7 μm breit und bis zu 70 mm lang). bildet kurzkettige Fettsäuren wie Butyrat Darmtrakt (Tier und Mensch)
Pseudoflavonifractor[13] Gram-negativ, Stäbchen oder kokkoid (P. hominis) Butyratproduktion Menschlicher und tierischer Darm
Ruminococcoides[14] Gram-positiv, Kokken, sporenbildend, ist resistent gegen Gallensäure Abbau resistenter Stärke zu Formiat und Acetat, einige Stämme bilden auch noch Lactat Menschlicher Darm, Galle
Ruminococcus[15] Gram-positiv, Kokken, bildet keine Sporen, Fermentation von Kohlenhydraten ergibt verschiedene Anteile von Acetat, Formiat, Succinat, Laktat und Ethanol Pansen, Dickdarm oder Blinddarm vieler Tiere und Menschen
Saccharofermentans[16] Gram-positiv, oval, nicht motil, Fermentationsprodukte von Glucose sind Butyrat, Acetat, Succinat und Lactat. Abwasser aus der Schlammbehandlung von Brauereien.
Subdoligranulum[17] Gram-negativ, nicht sporenbildend, kokkenförmig auch pleomorph Fermentation von Zuckern, bildet Succinat, Acetat, Lactat und Darmtrakt des Menschen und Tieren (z. B. in Hausgänse)[18]

Ökologie

Viele Arten sind Darmbakterien (s.h. Kapitel Medizinische Nutzung). Andere kommen z. B. im Boden oder Wasser vor.

Die Gattung Ethanoligenens beinhaltet Gram-positive, nicht sporenbildende, stäbchenförmige und motile Bakterien, die mesophile, also gemäßigte Wachstumsbedingungen bevorzugen. Der Gattungsname selbst weist auf die Fähigkeit dieser Organismen zur Ethanolproduktion hin. Ihr Stoffwechselweg umfasst die Fermentation von Glucose und anderen Kohlenstoffquellen, wobei Wasserstoff, Acetat, Kohlendioxid und Ethanol als Hauptprodukte entstehen. Aufgrund ihrer Fähigkeit zur Bio-Wasserstoffproduktion aus organischen Abfällen, einschließlich Abwasser, besitzen Ethanoligenens-Arten Potenzial für Anwendungen im Bereich der Bioenergie. Wasserstoff gilt als vielversprechende grüne Alternative zu fossilen Brennstoffen, da er ein effizienter Energieträger ist und bei der Verbrennung keine Treibhausgase erzeugt.[19] Ihr typischer Lebensraum sind anaerobe Umgebungen wie Klärschlamm.[20] Auch die Art Hydrogenoanaerobacterium saccharovorans könnte für die Produktion von Wasserstoff eingesetzt werden.[19]

Petroclostridium xylanilyticum baut Xylan ab und wurde aus dem Ölschlamm des Shengli-Ölfeldes in China isoliert. Ein optimales Wachstum fand bei 50 °C statt.[21] Thermocaproicibacter melissae ist thermophil ("wärmeliebend") und wächst bei Temperaturen von 37–60 °C. Es zeigt bestes Wachstum bei einer Temperatur von 50–55 °C. Durch Gärung bildet es u. a. die Verbindung n-Caproat.[22]

Vesiculincola pelomyxa kommt innerhalb der Amöbe Pelomyxa vor. Es lebt hier innerhalb von Vakuolen der Amöbenzelle. Es handelt sich um ein Konsortium mit der Amöbe und den Bakterien Candidatus Syntrophus pelomyxae (Klasse Deltaproteobacteria) und Candidatus Vesiculincola pelomyxae sowie dem methanogenen (also Methan bildendes) Archaeum Candidatus Methanoregula pelomyxae. Während Vesiculincola pelomyxa in Vakuolen vorkommt, leben die anderen zwei Arten frei im Cytosol der Amöbe.[23]

Medizinische Nutzung

Struktur von Buttersäure

Die Arten der Familie Oscillospiraceae bilden im Darm des Wirtes durch Fermentation kurzkettige Fettsäuren (SCFA), wie z. B. Butyrat und Lactat. Solche Verbindungen sind wichtig für das Darmepithels. Darüber hinaus wirken SCFA entzündungshemmend und fördern die Bildung von antimikrobiellen Peptide. Butyratt hilft die Barrierefunktionen des Darms aufrechtzuerhalten. Butyrat stärkt des Weiteren die Darmbarrierefunktion, indem es unter anderem die Expression von Tight Junctions-Proteinen stimuliert. Kurzkettige Fettsäuren senken außerdem den pH-Wert im Kolon und hemmen dadurch das Wachstum von möglichen pathogenen Bakterien.[1] Dies macht viele Arten der Oscillospiraceae interessant für die Nutzung als Probiotika. So besteht ein enger Zusammenhang zwischen Schwankungen in der Häufigkeit von der Gattung Oscillospira und Fettleibigkeit, Untergewicht und der menschlichen Gesundheit im Ganzen. Darüber hinaus hat eine wachsende Zahl von Studien gezeigt, dass Oscillospira auch bei anderen Krankheiten wie Gallensteinen und chronischer Verstopfung eine Rolle spielt und eine gewisse Korrelation mit den positiven oder negativen Veränderungen in deren Verlauf aufweist. Sequenzierungsdaten in Verbindung mit der Erstellung von Stoffwechselprofilen deuten darauf hin, dass Oscillospira wahrscheinlich eine Gattung ist, die in der Lage ist, kurzkettige Fettsäuren (SCFAs) wie Butyrat zu produzieren, was es sie für das Screening von Probiotika der nächsten Generation (next-generation probiotic) interessant macht. In Anbetracht der positiven Wirkungen von Oscillospira bei einigen spezifischen Krankheiten, wie z. B. fettleibigkeitsbedingten Stoffwechselkrankheiten, wurde es bereits als einer der Probiotika-Kandidaten der nächsten Generation charakterisiert und hat daher ein großes Potenzial für die Entwicklung und Anwendung in künftigen Lebensmitteln, Gesundheitsprodukten und Biopharmazeutikum.[12]

Subdoligranulum fermentiert ebenfalls Zucker und bildet Butyrat. Die Fähigkeit zur Butyratproduktion könnte zu den potenziellen gesundheitlichen Vorteilen dieser Gattung beitragen. Subdoligranulum-Arten sind im Darmtrakt von Menschen und Tieren zu finden. Interessanterweise wurde eine Verbindung zwischen dem Vorkommen von Subdoligranulum und Akkermansia muciniphila beobachtet. Dies könnte auf eine metabolische Interaktion zwischen diesen beiden Gattungen hindeuten.[24] Akkermansia wird ebenfalls als Probiotikum untersucht.[25]

Anaerotruncus ist im menschlichen Darm zu finden. Eine reduzierte Anzahl dieser Bakterien wurde mit einem erhöhten Body-Mass-Index (BMI) in Verbindung gebracht. Es kann auch entzündendhemmend wirken.

Faecalibacterium prausnitzii ist sehr häufig im menschlichen Darm und wird aufgrund seiner potenziellen gesundheitlichen Vorteile als vielversprechendes Probiotikum angesehen wird. Eine reduzierte Anzahl von Faecalibacterium-Bakterien wurde in zahlreichen Studien mit verschiedenen Krankheitszuständen in Verbindung gebracht.[26][27]

Das Darmmikorbium Lawsonibacter asaccharolyticus ist an dem Abbau von Kaffee beteiligt, es kommt vermehrt in der westlichen Welt, wo Kaffee häufig getrunken wird, vor.[28]

Systematik

Aufzeichnungen über die Typgattung Oscillospira erschienen erstmals vor einem Jahrhundert, als Chatton und Pérard im Blinddarm von Meerschweinchen Oscillospira guilliermondii entdeckten.[12] Die Familie Oscillospiraceae wurden früher als Ruminococcaceae geführt. Die Einführung der Familie Oscillospiraceae beruht auf neuen phylogenetischen Erkenntnissen. Hierzu zählen genetischen und genomischen Analysen, die eine feinere Unterscheidung innerhalb dieser Gruppe von Darmbakterien ermöglicht haben.

Die Oscillospiraceae zählen zu der Ordnung Eubacteriales (auch als Clostridiales bekannt), dies ist eine taxonomisch vielfältige Organismengruppe, die aus zahlreichen paraphyletischen Familien besteht. Seit 1975 wurden viele genomische Studien genutzt, um ihre phylogenetischen Beziehungen mithilfe der rRNA-Homologie zu reorganisieren und neu zu klassifizieren. Kürzlich wurden neue Organismen beschrieben und der Ordnung zugeordnet, und 2009 wurde die Familie Ruminococcaceae vorgeschlagen, um eine morphologisch, phänotypisch und physiologisch vielfältige Gruppe von Gattungen innerhalb der rRNA-Cluster III und IV zu umfassen. Technologische Fortschritte bei der genotypischen Klassifizierung mittels Protein- und Gesamtgenomsequenzierung haben weitere Fehlklassifizierungen innerhalb dieser Cluster zutage gefördert. Im Jahr 2018 schlugen Zhang und Mitarbeiter vor, die meisten Mitglieder des Clostridienclusters III in eine neue Familie, Hungateiclostridiaceae, umzuklassifizieren, die sich taxonomisch von den übrigen Mitgliedern der Familie Ruminococcaceae unterscheidet.[21] In einer taxonomischen Anmerkung aus dem Jahr 2019 teilte Tindall mit, dass eine Umklassifizierung zwar höchstwahrscheinlich auf Grundlage der Regeln des International Code of Nomenclature of Prokaryotes gerechtfertigt sei, es sich bei Hungateiclostridiaceae und Ruminococcaceae jedoch sowohl um gültig veröffentlichte aber unrechtmäßige Namen handele und die Mitglieder beider Familien unter dem priorisierten Familiennamen Oscillospiraceae zusammengefasst bleiben müssten, bis weitere Arbeiten und Korrekturen an der Familie erfolgt seien.[29][30]

In der Familie sind auch unkultivierte oder vorläufige Gattungen vorhanden, die oft durch den Zusatz "Candidatus" gekennzeichnet werden. Die Kultivierung einiger Mitglieder der Oscillospiraceae stellt eine wissenschaftliche Herausforderung dar, was unser detailliertes Verständnis ihrer Physiologie und Stoffwechselwege erschwert. In solchen Fällen stellen metagenomische Daten, die aus der direkten Sequenzierung von Umweltproben gewonnen werden, oft die primäre Informationsquelle dar.[31]

Im April 2025 waren über 50 Gattungen bekannt. Es folgt eine Liste einiger Gattungen:[32]

  • Acetanaerobacterium Chen and Dong 2004
  • Acutalibacter Lagkouvardos et al. 2016
  • "Candidatus Alloruminococcus" Glendinning et al. 2021
  • Amygdalobacter Srinivasan et al. 2023
  • Anaerobacterium Horino et al. 2014
  • Anaerofilum Zellner et al. 1996
  • Anaerotruncus Lawson et al. 2004
  • "Bittarella" Durand et al. 2017
  • Butyricicoccus Eeckhaut et al. 2008
  • Cellulosibacter Watthanalamloet et al. 2012
  • Ethanoligenens Xing et al. 2006
  • Faecalibacterium Duncan et al. 2002
  • Flavonifractor Carlier et al. 2010
  • Hydrogeniiclostridium corrig. Chaplin et al. 2020
  • Hydrogenoanaerobacterium Song and Dong 2009
  • Intestinimonas Kläring et al. 2013
  • Lawsonibacter Sakamoto et al. 2018
  • Monoglobus Kim et al. 2017
  • Neglectibacter Zgheib et al. 2024
  • Oscillibacter Iino et al. 2007
  • Oscillospira Chatton and Pérard 1913 (Approved Lists 1980)
  • Petroclostridium Zhang et al. 2018
  • Pseudoflavonifractor Carlier et al. 2010
  • Ruminococcoides Molinero et al. 2021
  • Ruminococcus Sijpesteijn 1948 (Approved Lists 1980)
  • Saccharofermentans Chen et al. 2010
  • "Candidatus Schneewindia" Glendinning et al. 2021
  • Solibaculum Sakamoto et al. 2021
  • Sporobacter Grech-Mora et al. 1996
  • Subdoligranulum Holmstrøm et al. 2004
  • Tepidibaculum Slobodkina et al. 2019
  • Thermocaproicibacter Nguyen et al. 2023
  • Thermoclostridium Zhang et al. 2018
  • Vescimonas Kitahara et al. 2021
  • "Yanshouia" Liu et al. 2021
  • Youxingia Liu et al. 2022
  • Zongyangia Liu et al. 2022

Einzelnachweise

  1. ↑ a b Fabian Frost: Einführung in das Mikrobiom. In: Die Innere Medizin. Band 63, Nr. 10, Oktober 2022, S. 1015–1021, doi:10.1007/s00108-022-01395-9.
  2. ↑ Christoph Ammer-Herrmenau, Jacob Hamm: Mikrobiom und gastrointestinale Erkrankungen. In: DGIM Innere Medizin. Springer Berlin Heidelberg, Berlin, Heidelberg 2023, ISBN 978-3-642-54676-1, S. 1–14, doi:10.1007/978-3-642-54676-1_578-1.
  3. ↑ Debora Garzetti, Lara Jochum und Bärbel Stecher: Acutalibacter (2019) In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1. Auflage. Wiley, 2015, ISBN 978-1-118-96060-8, doi:10.1002/9781118960608.gbm01730.
  4. ↑ Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1. Auflage. Wiley, 2015, ISBN 978-1-118-96060-8, doi:10.1002/9781118960608.gbm00673.
  5. ↑ V. Eeckhaut, F. Van Immerseel, E. Teirlynck, F. Pasmans, V. Fievez, C. Snauwaert, F. Haesebrouck, R. Ducatelle, P. Louis, P. Vandamme: Butyricicoccus pullicaecorum gen. nov., sp. nov., an anaerobic, butyrate-producing bacterium isolated from the caecal content of a broiler chicken. In: INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY. Band 58, Nr. 12, 1. Dezember 2008, S. 2799–2802, doi:10.1099/ijs.0.65730-0.
  6. ↑ Toshihiko Takada, Koichi Watanabe, Hiroshi Makino, Akira Kushiro: Reclassification of Eubacterium desmolans as Butyricicoccus desmolans comb. nov., and description of Butyricicoccus faecihominis sp. nov., a butyrate-producing bacterium from human faeces. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 66, Nr. 10, 1. Oktober 2016, S. 4125–4131, doi:10.1099/ijsem.0.001323.
  7. ↑ Defeng Xing, Nanqi Ren, Qiubo Li, Ming Lin, Aijie Wang, Lihua Zhao: Ethanoligenens harbinense gen. nov., sp. nov., isolated from molasses wastewater. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 56, Nr. 4, 1. April 2006, S. 755–760, doi:10.1099/ijs.0.63926-0.
  8. ↑ Sylvia H Duncan, Georgina L Hold, Hermie J M Harmsen, Colin S Stewart, Harry J Flint: Growth requirements and fermentation products of Fusobacterium prausnitzii, and a proposal to reclassify it as Faecalibacterium prausnitzii gen. nov., comb. nov. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 52, Nr. 6, 1. November 2002, S. 2141–2146, doi:10.1099/00207713-52-6-2141.
  9. ↑ Sylvia H. Duncan und Harry J. Flint: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1. Auflage. Wiley, 2015, ISBN 978-1-118-96060-8, doi:10.1002/9781118960608.gbm00674.
  10. ↑ Jennifer Gossling: Gemmiger. In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1. Auflage. Wiley, 2015, ISBN 978-1-118-96060-8, doi:10.1002/9781118960608.gbm00819.
  11. ↑ Caroline M. Plugge, Nam TP Bui: Intestinimonas (2019) In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1. Auflage. Wiley, 2015, ISBN 978-1-118-96060-8, doi:10.1002/9781118960608.gbm01736.
  12. ↑ a b c Laura Glendinning, Robert D. Stewart, Mark J. Pallen, Kellie A. Watson, Mick Watson: Assembly of hundreds of novel bacterial genomes from the chicken caecum. In: Genome Biology. Band 21, Nr. 1, Dezember 2020, doi:10.1186/s13059-020-1947-1, PMID 32051016, PMC 7014784 (freier Volltext).
  13. ↑ Corentine Alauzet, Catherine Cailliez-Grimal, Alain Lozniewski: Pseudoflavonifractor (2023) In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1. Auflage. Wiley, 2015, ISBN 978-1-118-96060-8, doi:10.1002/9781118960608.gbm01739.
  14. ↑ Natalia Molinero, Elena Conti, Borja Sánchez, Alan W. Walker, Abelardo Margolles, Sylvia H. Duncan, Susana Delgado: Ruminococcoides bili gen. nov., sp. nov., a bile-resistant bacterium from human bile with autolytic behavior. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 71, Nr. 8, 16. August 2021, doi:10.1099/ijsem.0.004960.
  15. ↑ Takayuki Ezaki: Ruminococcus In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1. Auflage. Wiley, 2015, ISBN 978-1-118-96060-8, doi:10.1002/9781118960608.gbm00678.
  16. ↑ Shuangya Chen: Saccharofermentans In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1. Auflage. Wiley, 2015, ISBN 978-1-118-96060-8, doi:10.1002/9781118960608.gbm01450.
  17. ↑ Kim Holmstrøm und Paul A. Lawson: Subdoligranulum In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1. Auflage. Wiley, 2015, ISBN 978-1-118-96060-8, doi:10.1002/9781118960608.gbm00680.
  18. ↑ J. Zhu, Y. Song, Y. Xiao, L. Ma, C. Hu, H. Yang, X. Wang, W. Lyu: Metagenomic reconstructions of caecal microbiome in Landes, Roman and Zhedong White geese. In: British Poultry Science. Band 64, Nr. 5, 3. September 2023, S. 565–576, doi:10.1080/00071668.2023.2239172.
  19. ↑ a b L. Song, X. Dong: Hydrogenoanaerobacterium saccharovorans gen. nov., sp. nov., isolated from H2-producing UASB granules. In: INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY. Band 59, Nr. 2, 1. Februar 2009, S. 295–299, doi:10.1099/ijs.0.000349-0.
  20. ↑ Lu Zhang, JongShik Chung, Nanqi Ren, Rui Sun: Effects of the ecological factors on hydrogen production and [Fe–Fe]-hydrogenase activity in Ethanoligenens harbinense YUAN-3. In: International Journal of Hydrogen Energy. Band 40, Nr. 21, Juni 2015, S. 6792–6797, doi:10.1016/j.ijhydene.2015.02.015.
  21. ↑ a b Xue Zhang, Bo Tu, Li-rong Dai, Paul A. Lawson, Zhen-zhen Zheng, Lai-Yan Liu, Yu Deng, Hui Zhang, Lei Cheng: Petroclostridium xylanilyticum gen. nov., sp. nov., a xylan-degrading bacterium isolated from an oilfield, and reclassification of clostridial cluster III members into four novel genera in a new Hungateiclostridiaceae fam. nov. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 68, Nr. 10, 1. Oktober 2018, S. 3197–3211, doi:10.1099/ijsem.0.002966.
  22. ↑ Tinh Van Nguyen, Tomeu Viver, Ilse Smets, Kristel Bernaerts, Karoline Faust, Rob Lavigne, Laurent Poughon, Claude-Gilles Dussap, Dirk Springael: Thermocaproicibacter melissae gen. nov., sp. nov., a thermophilic chain-elongating bacterium, producing n-caproate from polymeric carbohydrates. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 73, Nr. 5, 18. Mai 2023, doi:10.1099/ijsem.0.005893.
  23. ↑ Sebastian C Treitli, Pavla Hanousková, Vladimír Beneš, Andreas Brune, Ivan Čepička, Vladimír Hampl: Hydrogenotrophic methanogenesis is the key process in the obligately syntrophic consortium of the anaerobic ameba Pelomyxa schiedti. In: The ISME Journal. Band 17, Nr. 11, 1. November 2023, S. 1884–1894, doi:10.1038/s41396-023-01499-6, PMID 37634049, PMC 10579272 (freier Volltext).
  24. ↑ Matthias Van Hul, Tiphaine Le Roy, Edi Prifti, Maria Carlota Dao, Adrien Paquot, Jean-Daniel Zucker, Nathalie M. Delzenne, Giulio G. Muccioli, Karine Clément, Patrice D. Cani: From correlation to causality: the case of Subdoligranulum. In: Gut Microbes. Band 12, Nr. 1, 9. November 2020, S. 1849998, doi:10.1080/19490976.2020.1849998, PMID 33323004, PMC 7744154 (freier Volltext).
  25. ↑ Muriel Derrien, Caroline M. Plugge, Willem M. de Vos und Erwin G. Zoetandal: Akkermansia In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. 1. Auflage. Wiley, 2015, ISBN 978-1-118-96060-8, doi:10.1002/9781118960608.gbm01282.
  26. ↑ Haoyu Wang, Shengnan Yu, Kunyi Zhao, Tongyuan Hu, Zhinan Wu, Hewei Liang, Xiaoqian Lin, Luwen Cui, Jingtong Yao, Xiaomin Liu, Xin Tong, Ningning He, Liang Xiao, Karsten Kristiansen, Shangyong Li, Yuanqiang Zou: Faecalibacterium longum alleviates high-fat diet-induced obesity and protects the intestinal epithelial barrier in mice. In: Gut Microbes Reports. Band 2, Nr. 1, 31. Januar 2025, doi:10.1080/29933935.2025.2459599.
  27. ↑ Rebeca Martín, David Rios-Covian, Eugénie Huillet, Sandrine Auger, Sarah Khazaal, Luis G Bermúdez-Humarán, Harry Sokol, Jean-Marc Chatel, Philippe Langella: Faecalibacterium : a bacterial genus with promising human health applications. In: FEMS Microbiology Reviews. Band 47, Nr. 4, 5. Juli 2023, doi:10.1093/femsre/fuad039, PMID 37451743, PMC 10410495 (freier Volltext).
  28. ↑ Paolo Manghi, Amrisha Bhosle, Kai Wang, Roberta Marconi, Marta Selma-Royo, Liviana Ricci, Francesco Asnicar, Davide Golzato, Wenjie Ma, Dong Hang, Kelsey N. Thompson, Eric A. Franzosa, Amir Nabinejad, Sabrina Tamburini, Eric B. Rimm, Wendy S. Garrett, Qi Sun, Andrew T. Chan, Mireia Valles-Colomer, Manimozhiyan Arumugam, Kate M. Bermingham, Francesca Giordano, Richard Davies, George Hadjigeorgiou, Jonathan Wolf, Till Strowig, Sarah E. Berry, Curtis Huttenhower, Tim D. Spector, Nicola Segata, Mingyang Song: Coffee consumption is associated with intestinal Lawsonibacter asaccharolyticus abundance and prevalence across multiple cohorts. In: Nature Microbiology. Band 9, Nr. 12, 18. November 2024, ISSN 2058-5276, S. 3120–3134, doi:10.1038/s41564-024-01858-9, PMID 39558133, PMC 11602726 (freier Volltext) – (nature.com [abgerufen am 22. Mai 2025]).
  29. ↑ B. J. Tindall: The names Hungateiclostridium Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium thermocellum (Viljoen et al. 1926) Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium cellulolyticum (Patel et al. 1980) Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium aldrichii (Yang et al. 1990) Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium alkalicellulosi (Zhilina et al. 2006) Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium clariflavum (Shiratori et al. 2009) Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium straminisolvens (Kato et al. 2004) Zhang et al. 2018 and Hungateiclostridium saccincola (Koeck et al. 2016) Zhang et al. 2018 contravene Rule 51b of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes and require replacement names in the genus Acetivibrio Patel et al. 1980. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 69, Nr. 12, 1. Dezember 2019, S. 3927–3932, doi:10.1099/ijsem.0.003685.
  30. ↑ Sujatha Srinivasan, Michele N. Austin, Tina L. Fiedler, Susan M. Strenk, Kathy J. Agnew, G. A. Nagana Gowda, Daniel Raftery, May A. Beamer, Sharon L. Achilles, Harold C. Wiesenfeld, David N. Fredricks, Sharon L. Hillier: Amygdalobacter indicium gen. nov., sp. nov., and Amygdalobacter nucleatus sp. nov., gen. nov.: novel bacteria from the family Oscillospiraceae isolated from the female genital tract. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 73, Nr. 10, 3. Oktober 2023, doi:10.1099/ijsem.0.006017, PMID 37787404, PMC 11318147 (freier Volltext).
  31. ↑ N. Plomp, L. Liu, L. Walters, C. Bus-Spoor, M.T. Khan, P.O. Sheridan, A.C.M. Veloo, A.W. Walker, H.J.M. Harmsen, E. Tsompanidou: A convenient and versatile culturomics platform to expand the human gut culturome of Lachnospiraceae and Oscillospiraceae. In: Beneficial Microbes. Band 16, Nr. 1, 1. Januar 2017, S. 51–66, doi:10.1163/18762891-bja00042.
  32. ↑ LPSN - Oscillospiraceae
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