Die Perschaja Liha 2003 war die 13. Spielzeit der zweithöchsten belarussischen Spielklasse im Männerfußball. Sie begann am 19. April 2003 und endete am 12. November 2003.
Modus
Die 16 Mannschaften spielten an insgesamt 30 Spieltagen aufgeteilt in einer Hin- und einer Rückrunde jeweils zwei Mal gegeneinander. Der Meister und Zweitplatzierte stieg in die Wyschejschaja Liha 2004 auf. Der Tabellenletzte und -vorletzte stiegen in die Druhaja Liha ab.
Bei Punktgleichheit von zwei Mannschaften an der Tabellenspitze war ein Entscheidungsspiel um die Zweitliga-Meisterschaft vorgesehen.