Grimontviridae

Grimontviridae
Schemazeichnung, Podoviren-Subtyp C3
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Duplodnaviria Reich: Heunggongvirae Phylum: Uroviricota Klasse: Caudoviricetes Ordnung: incertae sedis Familie: Grimontviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear Baltimore: Gruppe 1 Symmetrie: ikosaedrisch, tailed (Podoviren) Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Grimontviridae
Links
ICTV Taxon History: 202414614 NCBI Taxonomy: 3044466

Grimontviridae ist eine im März/April 2023 als Familie eingerichtete Gruppe von Viren mit Kopf-Schwanz-Aufbau vom Morphotyp C (Podoviren). Ihre Wirte sind Bakterien, was sie als Bakteriophagen klassifiziert.^[2][3]

Innerhalb der Klasse Caudoviricetes gibt es vom Morphotyp C (Podoviren) eine seltene C3 genannte Variante, bei der die Virionen außer dem für Podoviren typischen kurzen „Schwanz“ einen stark verlängerten Kopf (d. h. ein nicht-isometrisches Kapsid) aufweisen. Die Grimontviridae sind neben den Mktvariviridae eine Familie solcher Podoviren vom Subtyp C3. Die Familie umfasst sechs Gründungs-Gattungen, deren Genome durchschnittlich 91,1 kbp (Kilobasenpaare) groß sind, bei einem G+C-Gehalt von 41,1 Mol%. Sie kodieren ca. 137 Proteine und 2–7 tRNAs.^[4]

Im Jahr 2008 wurde der lytische Cronobacter-Phage vB_CsaP_GAP52 in Guelph, Ontario (Kanada) mit dem Wirt Cronobacter sakazakii isoliert. Er besitzt einen länglichen Kopf (139 × 47 nm) und einen kurzen Schwanz (12 × 10 nm).^[4]

Der Cronobacter-Phage A24 wurde aus Flusswasser in Yuexiu, einem Stadtbezirk von Guangzhou (Kanton City), Provinz Guangdong (China), isoliert.^[4]

Im Durchschnitt sind die Genome der Gattung Crifsvirus 75,9 kbp groß bei einem G+C-Gehalt von 44,1 mol%, sie kodieren 11 Proteine und 2-3 tRNAs. Die Gattung ist zu Ehren des Canadian Research Institute in Food Safety (CRIFS)^[5] benannt, in dem Reza Abbasifar den Cronobacter-Phagen Gap52 isolierte.^[4]

Der Salmonella-Phage 7-11 (Salmonella Newport phage 7-11) wurde von der iranischen Biologin und Pionierin der Biokraftstofftechnologie Prof. Nasrin Moazami (geb. 1945)^[6] et al. gründlich charakterisiert.^[7] Es handelt sich um einen Virus vom Morphotyp der Podoviren, Subtyp C3, mit einem länglichen Kopf von 154 × 40 nm und einem Schwanz von 12 × 9 nm.^[4]

Der Salmonella-Phage pSal-SNUABM-01 wurde aus dem Nam-Fluss^[8] in Jinju (Südkorea), isoliert. Er besitzt ebenfalls einen länglichen Kopf (134 × 37,2 nm) und einen kurzen Schwanz (Länge 13 nm). Sein Genom ist zirkulär permutiert.^[9][4][10] (circular permutation, vergleiche Madisaviridae, Saparoviridae, Vertoviridae^[11] und die Zobellviridae-Gattung Citrovirus).

Salmonella-Phage SE131, wurde ebenfalls in Korea aus Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Enteritidis isoliert.^[4]

Im Durchschnitt sind die Genome der Gattung Moazamivirus 89,8 kbp groß bei einem G#C-Gehalt von 44,4 mol%; sie kodieren ~150 Proteine und 6-8 tRNAs.^[4]

Die Systematik der Grimontviridae ist nach International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) – (MSL#40v1), ergänzt um einige Vorschläge nach der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI) in Hochkommata mit Stand 16. April 2025 wie folgt:^[2][12][13]

Familie Grimontviridae

• ohne zugewiesene Unterfamilie

• Gattung Crifsvirus
  • Spezies Crifsvirus A24, mit Cronobacter-Phage A24
  • Spezies Crifsvirus GAP52, mit Cronobacter-Phage vB_CsaP_GAP52 alias GAP52
  • Spezies „Escherichia-Phage ECO319P1“ (Vorschlag)
• Gattung Dalianvirus
  • Spezies Dalianvirus R1, mit Vibrio-Phage Vp_R1
  • Spezies „Vibrio-Phage vB_VpaP_SJSY21“ (Vorschlag)
• Gattung Lahexavirus
  • Spezies Lahexavirus LAh6, mit Aeromonas-Phage LAh_6
  • Spezies Lahexavirus LAh8, mit Aeromonas-Phage LAh_8
  • Spezies Lahexavirus LAh9, mit Aeromonas-Phage LAh_9
  • Spezies Lahexavirus lv44572, mit Aeromonas-Phage 4_4572
• Gattung Libingvirus
  • Spezies Libingvirus BUCT695, mit Aeromonas-Phage BUCT695
• Gattung Lundtoftevirus
  • Spezies Lundtoftevirus Lu221, mit IncN-Phage Lu221 alias Phage PKM.Lu.22.1^[1]
• Gattung Moazamivirus^[4]
  • Spezies Moazamivirus 711, mit Salmonella-phage 7-11 alias Salmonella Newport phage 7-11
  • Spezies Moazamivirus SE131, mit Salmonella-Phage SE131
  • Spezies „Salmonella-Phage SeKF_80“
• Gattung Privateervirus
  • Spezies Privateervirus 3H1020, mit Proteus-Phage 3H10_20
  • Spezies Privateervirus P59, mit Proteus-Phage Vb_PmiP-P59
  • Spezies Privateervirus privateer, mit Proteus-Phage Privateer
  • Spezies Privateervirus pv009, mit Cronobacter-Phage vB_CsaP_009
• Gattung Trabzonvirus
  • Spezies Trabzonvirus APT65, mit Aeromonas-Phage APT65
• ohne Gattungszuweisung
  • Spezies „Proteus-Phage J3S“ (Vorschlag)
  • Spezies „Salmonella-Phage PKM.Hi.22.6“ (Vorschlag), mit Phage Hi226^[1]
  • Spezies „Salmonella-Phage pSal-SNUABM-01“ (Vorschlag)

Der Name der Familie Grimontviridae ehrt die französische Mikrobiologin Francine Grimont^[14][15][16] für ihre umfassende Untersuchung von Phagen, insbesondere der Viren des C3-Morphotyps; der Suffix ‚-viridae‘ kennzeichnet Virusfamilien.^[3][4]

1. ↑ ^{a b c d} Boris Parra, Bastiaan Cockx, Veronika T. Lutz, Lone Brøndsted, Barth F. Smets, Arnaud Dechesne: Isolation and characterization of novel plasmid-dependent phages infecting bacteria carrying diverse conjugative plasmids. In: Microbiology Spectrum, Band 12, Nr. 1, Dezember 2023, S. e0253723; doi:10.1128/spectrum.02537-23, ResearchGate:[1] (englisch).
2. ↑ ^{a b} ICTV: MSL #40.v1, 3. März 2025.
3. ↑ ^{a b} ICTV: Family: Grimontviridae .
4. ↑ ^{a b c d e f g h i j} Liliana Cristina Moraru, Yigang Tong, F. Tian, P. Mahadevan, Evelien M. Adriaenssens, Andrew M. Kropinski, Dann Turner: Create a new family (Grimontviridae) with five genera (Caudoviricetes). Vorschlag 2022.035B (zip:docx), Filelist. April 2022.
5. ↑ Canadian Research Institute for Food Safety. University of Guelph.
6. ↑ Wikidata: Nasrin Moazami (Q5854956).
7. ↑ Nasrin Moazamie (sic!), Hans-W. Ackermann, M. R. V. Murthy: Characterization of two Salmonella newport bacteriophages. In: Canadian Journal of Microbiology, Band 25, Nr. 9, 25. September 1979, S. 1063-1072; doi:10.1139/m79-163, PMID 540262 (englisch).
8. ↑ Wikidata: Nam River (Q485254).
9. ↑ Jun Kwon, Sang Guen Kim, Sib Sankar Giri, Hyoun Joong Kim, Sang Wha Kim, Jeong Woo Kang, Sung Bin Lee, Won Jun Jung, Cheng Chi, Se Chang Park: Genomic characterization of bacteriophage pSal-SNUABM-01, a novel elongated-head phage infecting Salmonella sp. In: Archives of Virology, Band 167, Nr. 2, Februar 2022, S. 655-658; doi:10.1007/s00705-021-05342-1, PMID 35043229, Epub 19. Januar 2022 (englisch).
10. ↑ Spencer Bliven, Andreas Prlić: Circular Permutation in Proteins. In: PLoS Computational Biology, Band 8, Nr. 3, 29. März 2012, S. e1002445; doi:10.1371/journal.pcbi.1002445 (englisch).
11. ↑ SIB: Vertoviridae. Auf: ViralZone.
12. ↑ ICTV: Master Species Lists (MSL).
13. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Grimontviridae, Details: Grimontviridae (family).
14. ↑ Wikidata: Francine Grimont (Q50912243).
15. ↑ Francine Grimont’s research while affiliated with Institut Pasteur and other places. Auf: ResearchGate.
16. ↑ Francine Grimont, Institut Pasteur, France. Auf: researech.com.