Duneviridae

Duneviridae

Schemazeichnung

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Duplodnaviria
Reich: Heunggongvirae
Phylum: Uroviricota
Klasse: Caudoviricetes
Ordnung: incertae sedis
Familie: Duneviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
(Siphoviren)
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Duneviridae
Links
ICTV Taxon History: 202413559
NCBI Taxonomy: 2946157
PhageDive: 1063 (Ingeline_1)

Duneviridae ist eine im Jahr 2022 als Familie eingerichtete Gruppe von Viren mit Kopf-Schwanz-Aufbau vom Morphotyp B (Siphoviren). Ihre Wirte sind Bakterien der Familie Flavobacteriaceae, was sie als Bakteriophagen, speziell Flavophagen, klassifiziert.[1][2][A. 1]

Beschreibung

Die Familie Duneviridae wurde (zusammen mit anderen) aufgrund eines Vorschlags eingerichtet, der darauf abzielte, einigen zu diesem Zeitpunkt neuen bzw. noch nicht klassifizierten Viren in die offizielle taxonomische Systematik aufzunehmen, die als sog. Flavophagen Mitglieder der Bakterien-Klasse Flavobacteriia infizieren. Die Familie umfasst als Gründungsmitglieder die drei Gattungen Ingelinevirus, Labanvirus und Unahavirus.[3][1] Diese teilen sich neun Kerngene, darunter insbesondere das Gen für das Hauptkapsidprotein (MCP).[3]

Der Cellulophaga-Phage Ingeline_1 als exemplarischer Vertreter der Spezies Ingelinevirus Ingeline infiziert Cellulophaga sp. HaHaR_3_176 (DSM 111152).[4] Diese Phagengruppe ist sehr vielfältig, wie acht Isolate, Ingeline_1 bis Ingeline_8, mit einer hohen Nukleotidähnlichkeit von über 99,9 % zeigen (Ingeline_7 und Ingeline_8 wurden in den Jahren 2017 und 2018 isoliert).[A. 2] Ingeline_1 hat einen Kapsiddurchmesser von 59,0 ± 5,3 nm, der „Schwanz“ hat eine Länge von 132,9 ± 19,3 nm bei einem Querschnitts­durchmesser von 11,2 ± 1,7 nm breit ist. Das dsDNA-Genom der Ingeline-Phagen hat eine Größe zwischen 42.624 und 42.797 bp (Basenpaaren) und einen GC-Gehalt von 32,2 %.Seine Gene kodieren für ein Kapsid (MCP), den Schwanz (TCP), einen Adaptor, ein Portal und ein potenzielles Spanin-Protein.[5] kodieren. Der im Transmissionselektronenmikroskop beobachtete Morphotyp entspricht dem der Siphoviren. Obwohl Ingeline in seinem ursprünglichen Cellulophaga-Wirt lytisch ist, kodiert das Genom auch zwei Integrasen, was auf eine potentielle Lysogenität hinweist.[3]

Systematik

Negativ gefärbte TEM-Aufnahme von Phage laban6-1 (vB_FspS_laban6-1, Labanvirus laban). Balken: 100 nm.[6]

Negativ gefärbte TEM-Aufnahmen von Flavo­bacterium-Phagen
i. tooticki6-1 (B_FspS_tooticki6-1, Mumin­virus tooticki)[A. 3] und
ii. laban6-1 (vB_FspS_laban6-1, Labanvirus laban). Balken: 100 nm.[6]

Die Systematik der Duneviridae ist nach International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), ergänzt um Vorschläge nach der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI) in Hochkommata mit Stand 29. April 2025 (MSL#40v1) wie folgt:[1][7][8]

Familie Duneviridae

  • ohne zugewiesene Unterfamilie
    • Gattung Ingelinevirus
      • Spezies Ingelinevirus ingeline, mit
        • Cellulophaga-Phage Ingeline_1[9] alias DSM 111236[10]
        – Wirt: Cellulophaga sp. HaHaR_3_176
        – Fundort: SW vom Dünenhafen, Insel Düne, Helgoland, Nordsee; 21. März 2017
      • Spezies „Cellulophaga-Phage Ingeline_2“
      • Spezies „Cellulophaga-Phage Ingeline_3“
      • Spezies „Cellulophaga-Phage Ingeline_4“
      • Spezies „Cellulophaga-Phage Ingeline_5“
      • Spezies „Cellulophaga-Phage Ingeline_6“
      • Spezies „Cellulophaga-Phage Ingeline_7“
      • Spezies „Cellulophaga-Phage Ingeline_8“
    • Gattung Labanvirus
      • Spezies Labanvirus laban (Flavobacterium-Virus Laban), mit
        • Flavobacterium-Phage vB_FspS_laban6-1 (vB_FspS_laban6-1)[11][6]
        – Wirt: Flavobacterium sp. LMO6
        – Fundort: in 2 m Tiefe, ca. 10 km östlich der Küste von Öland, Schweden, durch das Linnaeus Microbial Observatory (LMO)[12] am 16. September 2015[6]
    • Gattung Unahavirus (Flavobacterium-Phagencluster III, 4 Spezies)[13]
      • Spezies Unahavirus uv1H (im Vorschlag Unahavirus 1H, Flavobacterium-Virus 1H), mit
        • Flavobacterium-Phage 1H[14]
        – Wirt: Flavobacterium psychrophilum MH1[15]
        – Fundort: Chile, Marine Harves, 2008
      • Spezies Unahavirus uv23T (im Vorschlag Unahavirus 23T, Flavobacterium-Virus 23T), mit
        • Flavobacterium-Phage 23T
        – Wirt: Flavobacterium psychrophilum T23[15]
        – Fundort: Santiago, Chile, 2009
      • Spezies Unahavirus uv2A (im Vorschlag Unahavirus 2A, Flavobacterium-Virus 2A), mit
        – Wirt: Flavobacterium psychrophilum A2[15]
        – Fundort: Chile/Los Angeles, 2009
      • Spezies Unahavirus uv6H (im Vorschlag Unahavirus 6H, Flavobacterium-Virus 6H), mit
        • Flavobacterium-Phage 6H
        – Wirt: Flavobacterium psychrophilum MH1[15]
        – Fundort: Chile, Marine Harves, 2008
        • Spezies „Flavobacterium-Phage FPSV-D15“
        • Spezies „Flavobacterium-Phage FPSV-D17“
        • Spezies „Flavobacterium-Phage FPSV-D35“
        • Spezies „Flavobacterium-Phage FPSV-F7“

Namensherkunft (Etymologie)

Der Name der Familie Duneviridae verweist auf die Insel Düne, Nachbarinsel von Helgoland, wo die Ingeline-Phagen, Mitglieder der Familie, in Wasserproben entdeckt wurden; der Suffix ‚-viridae‘ kennzeichnet Virusfamilien.[2][3]

Der Gattungsname Ingelinevirus bezieht sich auf den Phagen Ingeline_1 als exemplarischen Vertrete (sowie die anderen Ingeline-Phagen). Ingeline ist ein Vorname friesischen Ursprungs, der Sprache, die auf Helgoland inklusive Düne gesprochen wird.[3]

Der Gattungsname Unahavirus ist ein Kofferwort, beannt nach dem exemplarischen Phagen 1H – lateinisch una ‚eins‘ (feminin) und ‚Ha‘ als Name des Buchstabens ‚H‘.

Der Gattungsname Labanvirus ist benannt nach dem exemplarischen Phagen FspS_laban6-1 (kurz laban6-1). Dessen Name verweist augenscheinlich auf kleine Gespenst Laban einer schwedischen Zeichentrickserie – ähnlich wie viele andere Bezeichnungen der von schwedischen Forschern isolierten Flavophagen sich auf schwedische Kindergeschichten beziehen, z. B. sind die die Mumins[A. 3] Namensgeber von Phagen der Gattung Muminvirus wie Mumin und Tooticki, und Pippi Langstrumpf ist Namensgeberin für die Spezies Pippivirus Pippi.

Anmerkungen

  1. ↑ Die Bezeichnung Flavophagen für die Viren der Flavobacteriia ist nicht zu verwechseln mit den Flaviviren, einer umgangssprachlichen Bezeichnung für die ssRNA-Viren der Familie Flaviviridae (und speziell der Gattung Orthoflavivirus – früher Flavi­virus), zu der u. a. der Erreger des Gelbfiebers gehört.
  2. ↑ Derzeit (2. Mai 2025) werden Ingeline_2 bis Ingeline_8 von ICTV als nicht zur Spezies Ingelinevirus Ingeline zugehörig erkannt, und die NCBI-Taxonomie führt sie als eigenständige Spezies ohne offizielle Bestätigung.
  3. ↑ a b Die Mumins sind nilpferdartige Trollwesen, erfunden von der finnlandschwedischen Autorin Tove Jansson, zur Namensherkunft von Muminvirus tooticki siehe Mumins: Tooticki und Tuulikki Pietilä: Tooticki.
  4. ↑ Nach Castillo et al. (2012 und 2016) hat Flavobacterium-Phage 2A abweichend den Morphotyp der Podoviren. Im Vorschlag 2021.029B zur Familie steht dazu nichts, im Vorschlag 2018.131B zur Gattung (mit Phage 2A als Gründungsmitglied) heißt es aber, dass alle Mitgieder Siphoviren seien.

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c ICTV: MSL #40.v1, 3. März 2025.
  2. ↑ a b ICTV: Family: Duneviridae.
  3. ↑ a b c d e Nina Bartlau, Liliana Cristina Moraru, Antje Wichels, Karin Holmfeldt, Evelien M. Adriaenssens, Rudolf Amann: Create nine new families (Pachyviridae, Pervagoviridae, Duneviridae, Helgolandviridae, Duneviridae, Molycolviridae, Winoviridae, Forsetiviridae, and Aggregaviridae) including 13 new genera and 18 new species (Caudoviricetes). Vorschlag 2021.029B (zip:docx), Filelist.
  4. ↑ BacDive ID: 169525. Species: Cellulophaga sp., Strain Designation: HaHaR_3_176, Culture col. no.: DSM 111152.
  5. ↑ SIB: Holin/endolysin/spanin cell lysis. Auf: ViralZone (Expasy).
  6. ↑ a b c d Emelie Nilsson, Oliver W. Bayfield, Daniel Lundin, Alfred A. Antson, Karin Holmfeldt: Diversity and Host Interactions among Virulent and Temperate Baltic Sea Flavobacterium Phages. In: MDPI. Viuses, Band 12, Nr. 2, Special Issue Viruses of Aquatic Ecosystems, 30. Januar 2020, S. 158; doi:10.3390/v12020158 (englisch).
  7. ↑ ICTV: Master Species Lists (MSL).
  8. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Duneviridae, Details: Duneviridae (family); Nucleotide: txid2946157[Organism:exp] , Duneviridae.
  9. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Cellulophaga phage Ingeline
  10. ↑ DSMZ: Cellulophaga phage Ingeline_1 (Ingelinevirus ingeline) DSM 111236.
  11. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Labanvirus laban (species, equivalent: Flavobacterium virus Laban)
  12. ↑ Linnaeus Microbial Observatory (LMO). Linné-Universität, Schweden (lnu.se).
  13. ↑ Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens, Daniel Elías Castillo Bermúdez: To create one (1) new genus, Unahavirus, containing four (4) species in the family Siphoviridae. Vorschlag 2018.131B (zip:docx), Filelist.
  14. ↑ NCBI: Unahavirus uv1H (species, equivalent: Flavobacterium virus 1H)
  15. ↑ a b c d Daniel Castillo, Mathias Middelboe: Genomic diversity of bacteriophages infecting the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum. In: Oxford Academic: FEMS Microbiology Letters, Band 363, Nr. 24, 2. Dezember 2016, S. fnw272; doi:10.1093/femsle/fnw272 (englisch).
  16. ↑ Daniel Castillo, G. Higuera, M. Villa, Mathias Middelboe, I. Dalsgaard, L. Madsen, R. T. Espejo: Diversity of Flavobacterium psychrophilum and the potential use of its phages for protection against bacterial cold water disease in salmonids. In: Journal of Fish Diseases, Band 35, Nr. 3, März 2012, S. 193–201; doi:10.1111/j.1365-2761.2011.01336.x, PMID 22324343 (englisch).
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